Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC38Q502W7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC38Q502W7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms