Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KNOP1Q1ED39 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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