Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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PTPRNQ16849 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
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PTPRNQ16849 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PTPRNQ16849 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PTPRNQ16849 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PTPRNQ16849 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PTPRNQ16849 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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PTPRNQ16849 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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PTPRNQ16849 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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PTPRNQ16849 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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PTPRNQ16849 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRNQ16849 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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PTPRNQ16849 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRNQ16849 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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