Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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