Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAMK4Q16566 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMK4Q16566 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMK4Q16566 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMK4Q16566 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMK4Q16566 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMK4Q16566 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAMK4Q16566 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms