Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIX1Q15475 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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