Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SYCP1Q15431 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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