Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN1Q14699 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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