Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CSHL1Q14406 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSHL1Q14406 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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