Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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