Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SHROOM2Q13796 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SHROOM2Q13796 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
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