Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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TUBA3CQ13748 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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TUBA3CQ13748 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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TUBA3CQ13748 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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