Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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