Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
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