Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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