Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3FQ13275 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
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