Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms