Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAF1AQ13111 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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