Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms