Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PTPRJQ12913 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PTPRJQ12913 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PTPRJQ12913 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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