Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFIAQ12857 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
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