Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
BPTFQ12830 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
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