Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
APOBRQ0VD83 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms