Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNA1Q09470 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNA1Q09470 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms