Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms