Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCZQ05513 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.7 ms