Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms