Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP1P78357 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP1P78357 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms