Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms