Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA3P59666 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms