Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms