Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms