Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ATP5EP56381 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms