Protein–RNA interactions for Protein: P55083

MFAP4, Microfibril-associated glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP4P55083 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MFAP4P55083 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MFAP4P55083 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MFAP4P55083 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MFAP4P55083 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MFAP4P55083 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MFAP4P55083 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MFAP4P55083 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MFAP4P55083 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MFAP4P55083 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MFAP4P55083 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MFAP4P55083 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MFAP4P55083 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MFAP4P55083 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MFAP4P55083 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MFAP4P55083 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms