Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLCP48506 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLCP48506 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLCP48506 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLCP48506 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLCP48506 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLCP48506 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLCP48506 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLCP48506 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLCP48506 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLCP48506 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLCP48506 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLCP48506 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLCP48506 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLCP48506 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLCP48506 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLCP48506 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLCP48506 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLCP48506 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLCP48506 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCLCP48506 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCLCP48506 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLCP48506 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLCP48506 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLCP48506 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLCP48506 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLCP48506 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLCP48506 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLCP48506 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLCP48506 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLCP48506 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLCP48506 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLCP48506 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLCP48506 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCLCP48506 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCLCP48506 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLCP48506 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLCP48506 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLCP48506 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLCP48506 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLCP48506 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLCP48506 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLCP48506 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLCP48506 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLCP48506 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLCP48506 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLCP48506 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLCP48506 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCLCP48506 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLCP48506 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLCP48506 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLCP48506 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLCP48506 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLCP48506 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms