Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP5P45974 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP5P45974 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP5P45974 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP5P45974 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP5P45974 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP5P45974 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP5P45974 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP5P45974 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP5P45974 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP5P45974 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP5P45974 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP5P45974 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP5P45974 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP5P45974 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP5P45974 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP5P45974 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP5P45974 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP5P45974 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP5P45974 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP5P45974 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP5P45974 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP5P45974 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP5P45974 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP5P45974 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP5P45974 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP5P45974 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP5P45974 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP5P45974 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP5P45974 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP5P45974 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP5P45974 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP5P45974 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP5P45974 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP5P45974 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP5P45974 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP5P45974 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP5P45974 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP5P45974 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP5P45974 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP5P45974 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP5P45974 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP5P45974 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP5P45974 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP5P45974 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP5P45974 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP5P45974 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP5P45974 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP5P45974 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP5P45974 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP5P45974 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP5P45974 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP5P45974 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP5P45974 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP5P45974 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP5P45974 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP5P45974 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP5P45974 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP5P45974 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP5P45974 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP5P45974 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP5P45974 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP5P45974 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP5P45974 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP5P45974 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP5P45974 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP5P45974 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP5P45974 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP5P45974 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP5P45974 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP5P45974 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms