Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms