Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FDFT1P37268 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms