Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5C1P36542 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms