Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GJC1P36383 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GJC1P36383 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJC1P36383 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJC1P36383 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJC1P36383 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GJC1P36383 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJC1P36383 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms