Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTX2P32243 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX2P32243 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX2P32243 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms