Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms