Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA11P31270 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA11P31270 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA11P31270 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA11P31270 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms