Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA9P31269 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms