Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMPK1P30085 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms