Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms