Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms