Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD247P20963 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD247P20963 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD247P20963 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD247P20963 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD247P20963 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD247P20963 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD247P20963 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD247P20963 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD247P20963 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD247P20963 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms