Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFAP15692 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VEGFAP15692 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms