Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FDPSP14324 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FDPSP14324 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FDPSP14324 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDPSP14324 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDPSP14324 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDPSP14324 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDPSP14324 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDPSP14324 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDPSP14324 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDPSP14324 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FDPSP14324 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDPSP14324 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDPSP14324 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FDPSP14324 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDPSP14324 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDPSP14324 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDPSP14324 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDPSP14324 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDPSP14324 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDPSP14324 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FDPSP14324 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDPSP14324 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDPSP14324 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDPSP14324 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDPSP14324 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDPSP14324 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDPSP14324 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDPSP14324 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDPSP14324 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDPSP14324 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDPSP14324 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDPSP14324 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDPSP14324 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDPSP14324 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDPSP14324 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FDPSP14324 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FDPSP14324 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDPSP14324 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDPSP14324 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDPSP14324 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDPSP14324 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDPSP14324 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FDPSP14324 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FDPSP14324 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDPSP14324 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDPSP14324 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDPSP14324 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDPSP14324 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FDPSP14324 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDPSP14324 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDPSP14324 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDPSP14324 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDPSP14324 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDPSP14324 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FDPSP14324 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDPSP14324 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDPSP14324 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDPSP14324 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDPSP14324 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDPSP14324 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDPSP14324 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDPSP14324 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDPSP14324 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDPSP14324 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDPSP14324 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDPSP14324 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDPSP14324 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDPSP14324 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDPSP14324 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDPSP14324 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FDPSP14324 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms